男性生殖器官疾病与性功能及生育功能有着密切关系，而且还可由于社会心理因素引起精神障碍影响到家庭美满和婚姻稳定。因此，男性生殖器官疾病历来受到人们的关注。以下将对男性生殖器官常见疾病做扼要介绍。
（一）男性生殖器官发育异常
1、性腺（睾丸）发育异常
（1）无睾症。由于没有睾丸，因此到青春发育期无男性第二性征出现，也没有生育能力。如仅是阴囊内未扪及睾丸，还不能诊断为无睾丸症，需与腹腔型隐睾作鉴别。治疗可从青春期起有规律地给予男性激素以防类宦官症。睾丸移植是治疗无睾症的理想方法，孪生兄弟间的睾丸移植不存在免疫排斥问题，但毕竟机会极少。
（2）先天性睾丸发育不全综合征（克氏综合征），又称先天性小睾丸症。约每400个出生男婴中就有一人发病。青春期前往往难以辨别。进入青春期由于睾丸不发育，则出现青春发育延迟或不发育。其特征为很少或不长胡须，阴毛、腋毛稀少，发音尖细，犹如女性。虽然他们的生殖器官是男性的，有阴茎、阴囊和睾丸，但若不给予治疗，到了成年，生殖器官仍如儿童。80％的人有女性化特征表现，如乳房发育、骨骼肌肉不像男性哪样粗壮，皮下有较多脂肪堆积等。其中许多人具有一定的性功能。阴茎能勃起，有的甚至能出现射精。但通常精液并无精子，当然就没有生育能力。这些人的下半身比上半身长，有些智力发育也延迟。对这类人可采用男性激素（睾酮）制剂长期替代治疗，以促进第二性征的发育，维待性欲和性功能。
（3）隐睾。在正常情况下，胎儿第8-9月时睾丸降入阴囊。但有3％在足月男婴和30％的早产男婴发生隐睾。这些男婴中大多数在出生后数月，睾丸即可降入阴囊。成人隐睾症约为0.3％-0.7％，双侧隐睾引起不育者近50-100%，单侧隐睾引起不育达30％-60％。 。
隐睾症若不及时冶疗可产生如下危害：①睾丸周围的温度较阴囊内高1.50c，滞留在腹股沟管内或腹腔内的睾丸可引起精子生成障碍而影响生育能力；②许多腹股沟型隐睾同时伴有腹股沟疝；③处于腹股沟管内睾丸位置表浅，固定差，睾丸容易受外力直接损伤；④发育不良和受伤后的睾丸容易发生恶变。发生恶变的时间多数在20岁以后，比正常睾丸恶变机会大40余倍。虽然手术后能将睾丸放入阴囊，但并不能防止以后恶变；⑤患者容易产生自卑心理，并忧虑成年后能否生育。双侧隐睾可试用内分泌治疗。若内分泌治疗失败，宜在2岁左右到医院做隐睾固定术。